RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 HCCSP53701 268 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 P2RX3P56373 397 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GPR50Q13585 617 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HNF4GQ14541 408 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CGB2Q6NT52 195 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 DRAM1Q8N682 238 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR56B4Q8NH76 319 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ENKURQ8TC29 256 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 THRSPQ92748 146 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TOMM40LQ969M1 308 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SLAMF9Q96A28 289 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RNFT2Q96EX2 444 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GON7Q9BXV9 100 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 C8orf4Q9NR00 106 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GAB2Q9UQC2 676 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 FUOMA2VDF0 154 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 H3BN98 237 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 AP4M1O00189 453 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CCRL2O00421 344 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 PSPNO60542 156 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC22O60826 627 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TTRP02766 147 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 STAG3L3P0CL85 134 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 GDNFP39905 211 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF91Q05481 1191 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CORO2AQ92828 525 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 V9GYS6 101 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01548A6NM66 108 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 IL1AP01583 271 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ELANEP08246 267 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 NFYBP25208 207 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 DUSP1P28562 367 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 PTGFRP43088 359 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR3A1P47881 315 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 HSPA13P48723 471 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TSPAN5P62079 268 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 FOXE3Q13461 319 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 MICAQ29983 383 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 AKAP14Q86UN6 197 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF429Q86V71 674 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 Q8IYB0 196 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 BVESQ8NE79 360 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR11H1Q8NG94 326 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TEX12Q9BXU0 123 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 U3KQV3 271 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 HERC2O95714 4834 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SIRPB1O00241 398 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ARPC2O15144 300 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 LDLRAD4O15165 306 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ATP8B1O43520 1251 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CYB5AP00167 134 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1D-33P01593 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-33P01594 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 HCKP08631 526 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR8U8P0C7N1 319 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CALCBP10092 127 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 GP9P14770 177 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 GPR12P47775 334 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 GLIPR1P48060 266 aa7.12□□□□□ -1.27
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