RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.33□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 S100A14Q9HCY8 104 aa13.33□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 AMBNQ9NP70 447 aa13.33□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.33□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ING3Q9NXR8 418 aa13.33□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 MEIKINA0A087WXM9 373 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 G3V4G9 280 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 PF4V1P10720 104 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 NFYBP25208 207 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 GLP1RP43220 463 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 BEAN1Q3B7T3 259 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 OR10A7Q8NGE5 316 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 JAM3Q9BX67 310 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 MMP28Q9H239 520 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 C8orf4Q9NR00 106 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 CKLFQ9UBR5 152 aa13.32□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 MMP23AO75900 390 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 LINC00596Q86U02 117 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 SGCDQ92629 289 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 TOMM40LQ969M1 308 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 OCSTAMPQ9BR26 566 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 METTL9Q9H1A3 318 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF286AQ9HBT8 521 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 RAB9BQ9NP90 201 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM138Q9NPI0 162 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 AASSQ9UDR5 926 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 TGP01266 2768 aa13.31□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 BAG2O95816 211 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 IL1AP01583 271 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 CD33P20138 364 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 GZMHP20718 246 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 OR3A4PP47883 348 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 RAB7AP51149 207 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 PAX5Q02548 391 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 MADCAM1Q13477 382 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 GPR176Q14439 515 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 CDK5R1Q15078 307 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ZSCAN26Q16670 478 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ABCA11PQ4W5N1 156 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 THNSL2Q86YJ6 484 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 LYG1Q8N1E2 194 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 SETD9Q8NE22 299 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM106AQ96A25 262 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 COQ2Q96H96 371 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 CALYQ9NYX4 217 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 FAM172BPA6NC97 362 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 GABRPO00591 440 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 HSPB6O14558 160 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 HTR3BO95264 441 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 PF4P02776 101 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 SOX2P48431 317 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 CD83Q01151 205 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 FBLN7Q53RD9 439 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 TTC23Q5W5X9 447 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF529Q6P280 563 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 Q8NFD4 153 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 OR10X1Q8NGY0 326 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 KIRREL1Q96J84 757 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 SLC29A1Q99808 456 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 NECAP2Q9NVZ3 263 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 IL36GQ9NZH8 169 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 KIF25Q9UIL4 384 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ING4Q9UNL4 249 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ST3GAL6Q9Y274 331 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF281Q9Y2X9 895 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa13.29□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 E9PI62 339 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 J3QR06 171 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 LPLP06858 475 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 LIMS3P0CW19 117 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 LIMS4P0CW20 117 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 BDKRB2P30411 391 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 C17orf58Q2M2W7 97 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 NHLRC3Q5JS37 347 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 C9orf152Q5JTZ5 239 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 DDI2Q5TDH0 399 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 ASCL4Q6XD76 172 aa13.28□□□□□ -0.28
SPNS1-211ENST00000568829 OR8H3Q8N146 312 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.3 ms