RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563498.1

NME3-204, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME3, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-204ENST00000563498 DEGS1O15121 323 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 APOL3O95236 402 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 OCM2P0CE71 109 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 RAB7AP51149 207 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 BNIP1Q12981 228 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 MADCAM1Q13477 382 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 HES1Q14469 280 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 TP53I3Q53FA7 332 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 FDX2Q6P4F2 183 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 OR8H3Q8N146 312 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 RFT1Q96AA3 541 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 POMPQ9Y244 141 aa14.72□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 CCL24O00175 119 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 ZNF85Q03923 595 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 CDK5R1Q15078 307 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 STPG2Q8N412 459 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 RFKQ969G6 155 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 RAX2Q96IS3 184 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 NEK6Q9HC98 313 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 ING3Q9NXR8 418 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 CALYQ9NYX4 217 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.71□□□□□ -0.05
NME3-204ENST00000563498 C3orf84H3BNL1 204 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 CCR9P51686 369 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 ATP6AP1Q15904 470 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 TEX38Q6PEX7 206 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 SPACA5Q96QH8 159 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 PSG11Q9UQ72 335 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 GYG2O15488 501 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 IL1AP01583 271 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 IGKV1D-33P01593 117 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 IGKV1-33P01594 117 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 GLP1RP43220 463 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 MTNR1BP49286 362 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 PAX5Q02548 391 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 EBI3Q14213 229 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 HNF4GQ14541 408 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR8U1Q8NH10 309 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 EME1Q96AY2 570 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 GON7Q9BXV9 100 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 AP4M1O00189 453 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 KIR2DS1Q14954 304 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 KLHL22Q53GT1 634 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 ELP2Q6IA86 826 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 LEAP2Q969E1 77 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 DUX3Q96PT4 197 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 CIB1Q99828 191 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 KIF25Q9UIL4 384 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 H0YJX3 145 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 IGHV3-7P01780 117 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 TMEM225BP0DP42 221 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 RAB25P57735 213 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 ZP1P60852 638 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 RNF152Q8N8N0 203 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-204ENST00000563498 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms