RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	AIRE	O43918	545 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	GPRIN2	O60269	458 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SMPD2	O60906	423 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SC5D	O75845	299 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	APOC1	P02654	83 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CCL1	P22362	96 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	PAX7	P23759	505 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ACKR3	P25106	362 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	TGFBR1	P36897	503 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	FABP6	P51161	128 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R43	P59537	309 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1CB	P62140	327 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	NCS1	P62166	190 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	FAM3A	P98173	230 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	BSPH1	Q075Z2	132 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	FAM166A	Q6J272	317 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZSR3	168 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	OR8H3	Q8N146	312 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	LRTM2	Q8N967	370 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	FGGY	Q96C11	551 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CMBL	Q96DG6	245 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	REEP6	Q96HR9	211 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	HHLA2	Q9UM44	414 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CAD	P27708	2225 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0U1RQV5	110 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GVI7	797 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC160	A6NGH7	325 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CD300LB	A8K4G0	201 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF879	B4DU55	563 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934		E7EQL1	145 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934		J3QKU1	62 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ABCD4	O14678	606 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CASK	O14936	926 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	FCGR3B	O75015	233 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	GABARAP	O95166	117 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN1	O95832	211 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	HLA-DPB1	P04440	258 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	OCM2	P0CE71	109 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SRM	P19623	302 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	GLRX	P35754	106 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	MPV17	P39210	176 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	TMBIM6	P55061	237 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	PAX9	P55771	341 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	VBP1	P61758	197 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	PSG7	Q13046	419 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SPCS2	Q15005	226 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934		Q499Y3	187 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	C22orf42	Q6IC83	251 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	OR2T2	Q6IF00	324 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF544	Q6NX49	715 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	BTNL8	Q6UX41	500 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINS1-210	ENST00000560934	SSX8	Q7RTT4	187 aa		3.67	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms