RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 V9GYS6 101 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN34H7C241 214 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CCL4P13236 92 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FOSL1P15407 271 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 BCL3P20749 454 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 HOXA6P31267 233 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35B1P78383 322 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R1AQ13522 171 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CBLN3Q6UW01 205 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM123Q8N131 208 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SNX22Q96L94 193 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SEC11CQ9BY50 192 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 Q9N2K0 584 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SLC31A2O15432 143 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 GREM1O60565 184 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 SULT1A1P50225 295 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 GUCA2AQ02747 115 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 BATFQ16520 125 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 IL22RA2Q969J5 263 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF716A6NP11 495 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RAB29O14966 203 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PS18 150 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CCL21O00585 134 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 OPN1MWP04001 364 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CD81P60033 236 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FGF12P61328 243 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 KLRB1Q12918 225 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RIGQ13278 110 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 TNXAQ16473 311 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 HSF4Q9ULV5 492 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF320A2RRD8 509 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SYNGR1O43759 233 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PITX3O75364 302 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF737O75373 536 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PPYP01298 95 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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