RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 Q8TCH9 128 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MOB3AQ96BX8 217 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 OR2V2Q96R30 315 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PHB2Q99623 299 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CFAP54Q96N23 3096 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 FAM172BPA6NC97 362 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 DBX1A6NMT0 343 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 HSPB6O14558 160 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 GOSR2O14653 212 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TUSC2O75896 110 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 DIRAS3O95661 229 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TK1P04183 234 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 VAMP1P23763 118 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 DNASE1P24855 282 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PRDX2P32119 198 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 PAX5Q02548 391 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 IGSF11Q5DX21 431 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LIN54Q6MZP7 749 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 C11orf88Q6PI97 169 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 CHIAQ9BZP6 476 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 RNF7Q9UBF6 113 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 SVILO95425 2214 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-209ENST00000547449 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 C17orf100A8MU93 164 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 SHISA9B4DS77 424 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 G3V3Q6 166 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 PSPNO60542 156 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 SIX6O95475 246 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 PPYP01298 95 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 CD3EP07766 207 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 PSG2P11465 335 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 EGR1P18146 543 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 PI3P19957 117 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 AADACP22760 399 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 SERPINF1P36955 418 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 H2BFSP57053 126 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 GMFBP60983 142 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 HLA-DRB3P79483 266 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 BAMBIQ13145 260 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 HERPUD1Q15011 391 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 EFNB3Q15768 340 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 SPRNQ5BIV9 151 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 BEX5Q5H9J7 111 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 CD177Q8N6Q3 437 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 COQ8AQ8NI60 647 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 LINC01560Q8TB33 94 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 FAM222BQ8WU58 562 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 OPN4Q9UHM6 478 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-209ENST00000547449 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 171.6 ms