RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 CBX5P45973 191 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 THBS3P49746 956 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 RBP2P50120 134 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 GNG2P59768 71 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PRDX4Q13162 271 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 MEF2DQ14814 521 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PPA1Q15181 289 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FAM189A2Q15884 450 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 GABRA6Q16445 453 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 TAF9Q16594 264 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 VAX1Q5SQQ9 334 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PLCXD3Q63HM9 321 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CALHM1Q8IU99 346 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 WDR31Q8NA23 367 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR2AK2Q8NG84 335 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 OR4K15Q8NH41 348 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 GPR137Q96N19 417 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 CFAP54Q96N23 3096 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 S100A13Q99584 98 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 IL36GQ9NZH8 169 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 KIAA1456Q9P272 454 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 MGAT4AQ9UM21 535 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 GPR132Q9UNW8 380 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 SLC7A11Q9UPY5 501 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-205ENST00000546248 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.59□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 CACNA1GO43497 2377 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PR80 420 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 CD300LBA8K4G0 201 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 SERPINE3A8MV23 424 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ATP6V1G1O75348 118 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 TOXO94900 526 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 CBR1P16152 277 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 HLA-GP17693 338 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 TBPP20226 339 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 EDN2P20800 178 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 CPT2P23786 658 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 GABRR1P24046 479 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 DNASE1P24855 282 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 CHATP28329 748 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 APLNRP35414 380 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 GPR12P47775 334 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 NPBWR2P48146 333 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 H2BFSP57053 126 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 DHODHQ02127 395 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ARFRP1Q13795 201 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ARL6IP1Q15041 203 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ZMYND11Q15326 602 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 RSU1Q15404 277 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 TSC22D1Q15714 1073 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 IGFBP7Q16270 282 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 Q5PR19 223 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 LY6G6FQ5SQ64 297 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 AADACL3Q5VUY0 350 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 RTL6Q6ICC9 239 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 LHFPL1Q86WI0 220 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 OSR2Q8N2R0 312 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms