RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 DAOP14920 347 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GNB3P16520 340 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 VAMP1P23763 118 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CPT2P23786 658 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PRR7Q8TB68 274 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ISOC2Q96AB3 205 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RAB3CQ96E17 227 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 COA4Q9NYJ1 87 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 COMMD9Q9P000 198 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 A0A0B4J2A0 478 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 A0A1B0GW55 424 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RBBP9O75884 186 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SFTPBP07988 381 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RNF224P0DH78 156 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR2B8PP59922 312 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 IKZF1Q13422 519 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR8G1Q15617 311 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 VHLLQ6RSH7 139 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MKXQ8IYA7 352 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 Q96M66 194 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NGBQ9NPG2 151 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUX4Q9UBX2 424 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DUSP13Q9UII6 198 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FOSL1P15407 271 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 AP3S2P59780 193 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DYRK1AQ13627 763 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 BATF2Q8N1L9 274 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TMED6Q8WW62 240 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SLAMF9Q96A28 289 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 C14orf79Q96F83 325 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DPRXA6NFQ7 191 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CD3DP04234 171 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MELTFP08582 738 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GABRR1P24046 479 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NPBWR2P48146 333 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 BSPH1Q075Z2 132 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MSMPQ1L6U9 139 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 AVPI1Q5T686 147 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF626Q68DY1 528 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OSR2Q8N2R0 312 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SVBPQ8N300 66 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR51I2Q9H344 312 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 LRP5LA4QPB2 252 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 F8VVB4 439 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 F8VWA3 439 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 H0YL77 283 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MLNRO43193 412 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SYNGR1O43759 233 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NQO2P16083 231 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 BCL3P20749 454 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GNLYP22749 145 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 UQCRFS1P47985 274 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TAF9Q16594 264 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SLC22A25Q6T423 547 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NUP37Q8NFH4 326 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PFDN5Q99471 154 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PKIBQ9C010 78 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MSL2Q9HCI7 577 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.38□□□□□ -1.23
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