RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534234.5

COPB1-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 1, humanhuman

TSL 5

Gene COPB1, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1-211ENST00000534234 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.13□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 A0A087X0M5 115 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 A0A1B0GX30 115 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 LY6LH3BQJ8 138 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 HSPB6O14558 160 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 BAG2O95816 211 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CD2P06729 351 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CGB3P0DN86 165 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CGB7P0DN87 165 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 OR3A4PP47883 348 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CD83Q01151 205 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 RSU1Q15404 277 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ZSCAN26Q16670 478 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CCDC58Q4VC31 144 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 UTF1Q5T230 341 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ZNF529Q6P280 563 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 OR9G1Q8NH87 305 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 GPR148Q8TDV2 347 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 APH1BQ8WW43 257 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 JAM3Q9BX67 310 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 KIF25Q9UIL4 384 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 OOSP1A8MZH6 123 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 EBAG9O00559 213 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 GABRPO00591 440 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 OR2F2O95006 317 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 HTR3BO95264 441 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 LPLP06858 475 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 DCKP27707 260 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 MNDAP41218 407 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 GLP1RP43220 463 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ETV1P50549 477 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 XAF1Q6GPH4 301 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ASCL4Q6XD76 172 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 Q8NFD4 153 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 RFESDQ8TAC1 157 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TMEM106AQ96A25 262 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 KIRREL1Q96J84 757 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CALYQ9NYX4 217 aa7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 A0A1W2PRX2 142 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 J3QR06 171 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 CDRT1O95170 752 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 IGHV3-7P01780 117 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 AMY1AP04745 511 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 AMY2AP04746 511 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 FAM106CPP0CH98 169 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 KCNJ3P48549 501 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 IL13RA2Q14627 380 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 PIGYQ3MUY2 71 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 FBLN7Q53RD9 439 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 SGCDQ92629 289 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 LEAP2Q969E1 77 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 RPEQ96AT9 228 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 RDH12Q96NR8 316 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ING4Q9UNL4 249 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 PSG11Q9UQ72 335 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.1□□□□□ -1.27
COPB1-211ENST00000534234 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms