RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 ARL6IP1Q15041 203 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 NEK7Q8TDX7 302 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 HSF4Q9ULV5 492 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 CSPG4Q6UVK1 2322 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 TLN2Q9Y4G6 2542 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 A8MV72 311 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 LY6G6DO95868 133 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 PPIAL4GP0DN37 164 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 CHATP28329 748 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 EDDM3AQ14507 147 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 PDCD1Q15116 288 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 NICN1Q9BSH3 213 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00312Q9Y6C7 94 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 KRBOX4Q5JUW0 171 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FGFRL1Q8N441 504 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OR6C3Q9NZP0 311 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 KPTNQ9Y664 436 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0A6YYH2 397 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0B4J203 849 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PPE2 198 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PR64 198 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PRV1 198 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A6NJ64 397 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 HSPB6O14558 160 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 VEGFCP49767 419 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SPCS2Q15005 226 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SIGIRRQ6IA17 410 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SLC35E4Q6ICL7 350 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PHF21AQ96BD5 680 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 CMTM3Q96MX0 182 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 MMP26Q9NRE1 261 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 M0R1W7 72 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PAHP00439 452 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 RBP4P02753 201 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 HNF1AP20823 631 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PAX8Q06710 450 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 MZT2AQ6P582 158 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0A6YYD4 124 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ODAMA1E959 279 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 AESQ08117 197 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OR10R2Q8NGX6 335 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FAHD2AQ96GK7 314 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 COQ2Q96H96 371 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SMR3AQ99954 134 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 C7orf69Q9H7B7 122 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ETAA1Q9NY74 926 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 AUP1Q9Y679 476 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 HIVEP2P31629 2446 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 POM121CA8CG34 1229 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 EFNB2P52799 333 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 Q6ZTK2 550 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 GAPTQ8N292 157 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 RAB3CQ96E17 227 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ABCG5Q9H222 651 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ONECUT1Q9UBC0 465 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 RAB27BO00194 218 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SOCS1O15524 211 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 CORO2AQ92828 525 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF714Q96N38 554 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 RAB9BQ9NP90 201 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms