RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, human

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGGT1B-205	ENST00000514178	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	GPR82	Q96P67	336 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	DSN1	Q9H410	356 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ELP1	O95163	1332 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178		A8MWL6	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	UPK2	O00526	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	M6PR	P20645	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	PSMB6	P28072	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	LGALS7	P47929	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178		Q499Y3	187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	CCL17	Q92583	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	CBR3	O75828	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TSPO	P30536	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	COX19	Q49B96	90 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	PITX2	Q99697	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TPM3	P06753	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	PLTP	P55058	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	CCL23	P55773	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TPM4	P67936	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	FFAR1	O14842	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	BNIP2	Q12982	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	HBEGF	Q99075	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	PXDN	Q92626	1479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178		E9PCH4	1651 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	KIF1B	O60333	1816 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	IL4	P05112	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	NTF3	P20783	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	TGFBR1	P36897	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	UBE2G2	P60604	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PGGT1B-205	ENST00000514178	SSX1	Q16384	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms