RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512677.1

PIK3R4-208, Transcript of phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PIK3R4, Length 744 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3R4-208	ENST00000512677	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		A0A0G2JK05	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	GABRP	O00591	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TOR1A	O14656	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF737	O75373	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CLPX	O76031	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	HTR3B	O95264	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR2H2	O95918	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SFTPB	P07988	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CPE	P16870	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SRM	P19623	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	AMY2B	P19961	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MYL9	P24844	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	BRS3	P32247	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	NPBWR2	P48146	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SCN1B	Q07699	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IRF3	Q14653	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		Q3ZCU0	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MGLL	Q99685	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ODAM	A1E959	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SIRPB1	O00241	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CCRL2	O00421	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ORC5	O43913	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SCGN	O76038	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	VENTX	O95231	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MAS1	P04201	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	UCHL1	P09936	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	HKR1	P10072	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SERPINA2	P20848	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IL3RA	P26951	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	HTR1D	P28221	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	HTR2C	P28335	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MNDA	P41218	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	GLP1R	P43220	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms