RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 REM1O75628 298 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SCO1O75880 301 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SLC2A10O95528 541 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 FABP3P05413 133 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-DQB2P05538 268 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 FGF2P09038 288 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 GM2AP17900 193 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 MYL9P24844 172 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PFN2P35080 140 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PTGDSP41222 190 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 HERV-K104P61576 105 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 NECTIN1Q15223 517 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF726P1Q15940 193 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 CCL15Q16663 113 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 ZFP69Q49AA0 526 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 FAM106AQ4KMX7 169 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PRR31Q5SQ13 230 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM219Q86XT9 240 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PACRGLQ8N7B6 248 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 OR2T33Q8NG76 320 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 OR5W2Q8NH69 310 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM230Q96A57 120 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 NDFIP1Q9BT67 221 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SAMD10Q9BYL1 202 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 LPAR5Q9H1C0 372 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 HS3ST2Q9Y278 367 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 RTL1A6NKG5 1358 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 CACNA1FO60840 1977 aa6□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 NAIPQ13075 1403 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 CHD1O14646 1710 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 GAGE12BA1L429 117 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SNAPC5O75971 98 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SEMA4FO95754 770 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 OR4A8P0C604 315 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 FAM106CPP0CH98 169 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 KDELR1P24390 212 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 CNTFRP26992 372 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SHC1P29353 583 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SRIP30626 198 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 GNG4P50150 75 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 H2BFSP57053 126 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 TAS2R20P59543 309 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 HBG1P69891 147 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 HBG2P69892 147 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF626Q68DY1 528 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 UBALD2Q8IYN6 164 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 OR5K1Q8NHB7 308 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 BLNKQ8WV28 456 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 GPR146Q96CH1 333 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 FMC1Q96HJ9 113 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SPHK2Q9NRA0 654 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SSH2Q76I76 1423 aa5.99□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PCM1Q15154 2024 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 MYO5BQ9ULV0 1848 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 B4DXG7 233 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 K7EQS6 105 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 ITM2AO43736 263 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 TBL1XO60907 577 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINE1P05121 402 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 SCTP09683 121 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PPICP45877 212 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 APOC4P55056 127 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 MTPNP58546 118 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 BTG1P62324 171 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF85Q03923 595 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 UNC50Q53HI1 259 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 HOGA1Q86XE5 327 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCD4-211ENST00000498367 CT55Q8WUE5 264 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms