RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	MMP23A	O75900	390 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHV4-59	P01825	116 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSN2	P05814	226 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	UCHL1	P09936	223 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	SRM	P19623	302 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	AWAT2	Q6E213	333 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CORO2A	Q92828	525 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC25A28	Q96A46	364 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHIA	Q9BZP6	476 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	NOTCH1	P46531	2555 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ODAM	A1E959	279 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	MEGF11	A6BM72	1044 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBP4	P02753	201 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	GDNF	P39905	211 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	IER3	P46695	156 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	FABP5	Q01469	135 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	SSX1	Q16384	188 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAF9	Q16594	264 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	C16orf87	Q6PH81	154 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	BRICD5	Q6PL45	260 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPART	Q8N0X7	666 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYYR1	Q96J86	154 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	BANF2	Q9H503	90 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBP1	P09467	338 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	HKR1	P10072	659 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	GTF2F2	P13984	249 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPR176	Q14439	515 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAM1	Q15629	374 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM104	Q8NE00	496 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	PHYHIP	Q92561	330 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	GFI1	Q99684	422 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFT22	Q9H7X7	185 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIF25	Q9UIL4	384 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ODF3B	A8MYP8	253 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLPX	O76031	633 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAH	P00439	452 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARG1	P05089	322 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CGB3	P0DN86	165 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CGB7	P0DN87	165 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CD37	P11049	281 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	OMG	P23515	440 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	GABRA5	P31644	462 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	MPV17L	Q2QL34	196 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM86B	Q8N661	226 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNK15	Q9H427	330 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC42	Q9Y546	428 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM172BP	A6NC97	362 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	MGMT	P16455	207 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDK2	P24941	298 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	UTF1	Q5T230	341 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF626	Q68DY1	528 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR10K2	Q6IF99	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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