RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	SLC16A6	O15403	523 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ENTPD6	O75354	484 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR2H2	O95918	312 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ISG15	P05161	165 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	HCK	P08631	526 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM225B	P0DP42	221 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF44	P15621	663 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CDK2	P24941	298 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CEACAM3	P40198	252 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	KIR3DL2	P43630	455 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CCR9	P51686	369 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DYNLT3	P51808	116 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PRRX1	P54821	245 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	P2RX3	P56373	397 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	BLCAP	P62952	87 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF85	Q03923	595 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF146	Q15072	292 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853		Q8N2B8	174 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	C4orf36	Q96KX1	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853		Q96MT0	163 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SPACA5	Q96QH8	159 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	HMG20A	Q9NP66	347 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1W2PRX2	142 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MAGEB3	O15480	346 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PF4V1	P10720	104 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MNDA	P41218	407 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PTGFR	P43088	359 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR3A1	P47881	315 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	GLIPR1	P48060	266 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	AES	Q08117	197 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SATL1	Q86VE3	508 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MBOAT4	Q96T53	435 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	GPER1	Q99527	375 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MMP28	Q9H239	520 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	RHOF	Q9HBH0	211 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	DHDH	Q9UQ10	334 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ODAM	A1E959	279 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	FAM172BP	A6NC97	362 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	EI24	O14681	340 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MPZL2	O60487	215 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MMP23A	O75900	390 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	KDM4B	O94953	1096 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MT-ND2	P03891	347 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ALPL	P05186	524 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	CD24	P25063	80 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	NFYB	P25208	207 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	OR3A4P	P47883	348 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ALDH3A2	P51648	485 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ISL1	P61371	349 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	BDH1	Q02338	343 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	GALE	Q14376	348 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	KISS1	Q15726	138 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM39-238	ENST00000493853	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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