RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	ETV1	P50549	477 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ORAI1	Q96D31	301 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	JAM3	Q9BX67	310 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	KIF25	Q9UIL4	384 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MAGEB3	O15480	346 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CDRT1	O95170	752 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	HTR3B	O95264	441 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CLIC3	O95833	236 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ALDOB	P05062	364 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	LPL	P06858	475 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CD34	P28906	385 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PRRX1	P54821	245 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RSU1	Q15404	277 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PXT1	Q8NFP0	134 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ING4	Q9UNL4	249 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	LY6L	H3BQJ8	138 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618		H3BUI4	141 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CEACAM3	P40198	252 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	GNG10	P50151	68 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF529	Q6P280	563 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A087X0M5	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1B0GX30	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2F2	O95006	317 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	AMY1A	P04745	511 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	AMY2A	P04746	511 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CGB3	P0DN86	165 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CGB7	P0DN87	165 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR148	Q8TDV2	347 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1W2PPE3	182 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618		J3QR06	171 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	XPNPEP2	O43895	674 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	LALBA	P00709	142 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	SSTR5	P35346	364 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MNDA	P41218	407 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CD83	Q01151	205 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RPE	Q96AT9	228 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54

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