RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 LEAP2Q969E1 77 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 Q96MT0 163 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 KIF25Q9UIL4 384 aa14.72□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 FUOMA2VDF0 154 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 LEUTXA8MZ59 168 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 CLIC3O95833 236 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 IGHV3-7P01780 117 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 OR3A4PP47883 348 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 CD83Q01151 205 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 ORAI1Q96D31 301 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 CALYQ9NYX4 217 aa14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHD1L-209ENST00000492728 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OR2F2O95006 317 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 LALBAP00709 142 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 LPLP06858 475 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RAB3AP20336 220 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 NFYBP25208 207 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 ASCL4Q6XD76 172 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 SATL1Q86VE3 508 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 Q8NFD4 153 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.7□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 PEX14O75381 377 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 CDRT1O95170 752 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 ALDOBP05062 364 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 SSTR5P35346 364 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 IL13RA2Q14627 380 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 PHF21AQ96BD5 680 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OR4F4Q96R69 305 aa14.69□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 A0A1W2PPI3 338 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 TOR1AO14656 332 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 IL1AP01583 271 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 BRS3P32247 399 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 LTC4SQ16873 150 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 KLHL22Q53GT1 634 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RFESDQ8TAC1 157 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 GPR148Q8TDV2 347 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 STMN2Q93045 179 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM106AQ96A25 262 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 GPER1Q99527 375 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.68□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 A0A1W2PP11 408 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 XPNPEP2O43895 674 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 CEACAM3P40198 252 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 PAX5Q02548 391 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 DOC2BQ14184 412 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OR9G1Q8NH87 305 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 CYYR1Q96J86 154 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 PSG11Q9UQ72 335 aa14.67□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 J3QR06 171 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 HTR3BO95264 441 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 BAG2O95816 211 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 GNG10P50151 68 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms