RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486812.5

PRDM15-212, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM15, Length 7,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-212ENST00000486812 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.15□□□□□ -0.94
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PRDM15-212ENST00000486812 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PRDM15-212ENST00000486812 TNFSF11O14788 317 aa9.15□□□□□ -0.94
PRDM15-212ENST00000486812 C1QL1O75973 258 aa9.15□□□□□ -0.94
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PRDM15-212ENST00000486812 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PRDM15-212ENST00000486812 CHD4Q14839 1912 aa9.15□□□□□ -0.94
PRDM15-212ENST00000486812 UMODP07911 640 aa9.15□□□□□ -0.94
PRDM15-212ENST00000486812 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
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PRDM15-212ENST00000486812 PDPNQ86YL7 162 aa9.15□□□□□ -0.94
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PRDM15-212ENST00000486812 TMEM140Q9NV12 185 aa9.14□□□□□ -0.95
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PRDM15-212ENST00000486812 TWIST1Q15672 202 aa9.14□□□□□ -0.95
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PRDM15-212ENST00000486812 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.14□□□□□ -0.95
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PRDM15-212ENST00000486812 OR8B2Q96RD0 313 aa9.13□□□□□ -0.95
PRDM15-212ENST00000486812 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.13□□□□□ -0.95
PRDM15-212ENST00000486812 CST9LQ9H4G1 147 aa9.13□□□□□ -0.95
PRDM15-212ENST00000486812 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.13□□□□□ -0.95
PRDM15-212ENST00000486812 SCN4AP35499 1836 aa9.13□□□□□ -0.95
PRDM15-212ENST00000486812 A6NCN8 305 aa9.13□□□□□ -0.95
PRDM15-212ENST00000486812 H0YGG7 62 aa9.13□□□□□ -0.95
PRDM15-212ENST00000486812 FGF17O60258 216 aa9.13□□□□□ -0.95
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