RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 IGFBP2P18065 325 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PTGER4P35408 488 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GLIPR1P48060 266 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CCL11P51671 97 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ERVS71-1P61550 626 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 LEG1Q6P5S2 330 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM156Q8N614 296 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RAB18Q9NP72 206 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 H3BQ15 152 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR5H8P0DN80 308 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF708P17019 499 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 UBE2G2P60604 165 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MDGA2Q7Z553 956 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZG16BQ96DA0 208 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SNX22Q96L94 193 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ARV1Q9H2C2 271 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 UTS2O95399 124 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MAS1P04201 325 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 STAG3L3P0CL85 134 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 IL11P20809 199 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ADAM8P78325 824 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 IQCJQ1A5X6 159 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 EMC4Q5J8M3 183 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZAR1Q86SH2 424 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GGNQ86UU5 652 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF524Q96C55 264 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF479Q96JC4 524 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR8B4Q96RC9 309 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CALHM2Q9HA72 323 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.64□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 A6NIZ1 184 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SCDO00767 359 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC25A17O43808 307 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PGA4P0DJD7 388 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PGA5P0DJD9 388 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PTNP21246 168 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CXCR1P25024 350 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 LHX2P50458 406 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TAS2R31P59538 309 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FOXF1Q12946 379 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 IL15RAQ13261 267 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 LFNGQ8NES3 379 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PFN4Q8NHR9 129 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TOMM40LQ969M1 308 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TP53RKQ96S44 253 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 VAX2Q9UIW0 290 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PPIAL4DF5H284 164 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 K7EPK0 472 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 IFNA21P01568 189 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CST2P09228 141 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SEC11BP0C7V7 166 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 AKR1C4P17516 323 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MEOX1P50221 254 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF136P52737 540 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 UBE2KP61086 200 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC35A1P78382 337 aa6.63□□□□□ -1.35
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