RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485407.1

NHLRC3-205, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene NHLRC3, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-205ENST00000485407 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GGTLC2Q14390 218 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DEGS2Q6QHC5 323 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DRAM2Q6UX65 266 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR6K6Q8NGW6 343 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SYNPRQ8TBG9 265 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 NRGNQ92686 78 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SPTSSAQ969W0 71 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 Q96MT0 163 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 TEAD3Q99594 435 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC29A1Q99808 456 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ATF6BQ99941 703 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CITED1Q99966 193 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DCTN5Q9BTE1 182 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 YIPF3Q9GZM5 350 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR51V1Q9H2C8 321 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 NIPAL2Q9H841 368 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZANQ9Y493 2812 aa4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 A0A087WZ39 114 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ACOD1A6NK06 481 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 FAM183AA6NL82 134 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF878C9JN71 531 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 H0YJX3 145 aa4.59□□□□□ -1.67
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NHLRC3-205ENST00000485407 M0R233 179 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PRKYO43930 277 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF254O75437 659 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CDK2AP2O75956 126 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DFFBO76075 338 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GYPBP06028 91 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CCL2P13500 99 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ALOX5APP20292 161 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 CCNOP22674 350 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 HTR1FP30939 366 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 EFNA4P52798 201 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ATP5J2P56134 94 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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NHLRC3-205ENST00000485407 PPP1CBP62140 327 aa4.59□□□□□ -1.67
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NHLRC3-205ENST00000485407 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 APOFQ13790 326 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 IL18Q14116 193 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 KLHL12Q53G59 568 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 STEAP1BQ6NZ63 245 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 FBXW12Q6X9E4 464 aa4.59□□□□□ -1.67
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NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF101Q8IZC7 436 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR52H1Q8NGJ2 320 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 OTOSQ8NHW6 89 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 RNF133Q8WVZ7 376 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ASB17Q8WXJ9 295 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PIGCQ92535 297 aa4.59□□□□□ -1.67
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NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF799Q96GE5 643 aa4.59□□□□□ -1.67
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NHLRC3-205ENST00000485407 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 IL4I1Q96RQ9 567 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 MROQ9BYG7 248 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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NHLRC3-205ENST00000485407 RGCCQ9H4X1 137 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GHRLQ9UBU3 117 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF391Q9UJN7 358 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PIGLQ9Y2B2 252 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa4.59□□□□□ -1.67
NHLRC3-205ENST00000485407 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.59□□□□□ -1.67
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