RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM50AO95807 157 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 ESDP10768 282 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 PGGT1BP53609 377 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 ADM5C9JUS6 153 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 SYNGR2O43760 224 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 Q8WTZ3 238 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 SYT11Q9BT88 431 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 GNG7O60262 68 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 NHLRC3Q5JS37 347 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 SLC25A30Q5SVS4 291 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 LINC00587B1AMM8 73 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 UBE2CO00762 179 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 IGSF21Q96ID5 467 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.14□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 C11orf40Q8WZ69 217 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 AICDAQ9GZX7 198 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 RAXQ9Y2V3 346 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 OR51B2Q9Y5P1 312 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1W2PQU0 124 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 LAT2Q9GZY6 243 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 A6NCN8 305 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM215Q68D42 235 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 LINC00596Q86U02 117 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 OTOSQ8NHW6 89 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 CA10Q9NS85 328 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 EFSO43281 561 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 PMELP40967 661 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 POU2AF1Q16633 256 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TUBA4BQ9H853 241 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM30AQ9NV96 361 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 HPRT1P00492 218 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 RBKSQ9H477 322 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1B0GW15 77 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 CST6Q15828 149 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 RAB9AP51151 201 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM140Q9NV12 185 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 MED12LQ86YW9 2145 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 LINC00869P0C866 280 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TRGC1P0CF51 173 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 OR11H12B2RN74 326 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 OR11H1Q8NG94 326 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 OR11H2Q8NH07 326 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.13□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 SOCS7O14512 581 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 RBPJQ06330 500 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 C2orf88Q9BSF0 95 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 GOSR1O95249 250 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 DLK2Q6UY11 383 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 EDN1P05305 212 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 PTX4Q96A99 478 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 FAM157CP0CG43 387 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TEX37Q96LM6 180 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 KIR3DL2P43630 455 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 SOD2P04179 222 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 AGAP20933 346 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.12□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 A8MXK9 166 aa11.11□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.11□□□□□ -0.63
SOGA3-207ENST00000481848 OR2V1Q8NHB1 315 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms