RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 GPR176Q14439 515 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B12Q53GQ0 312 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 AWAT2Q6E213 333 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 OR13D1Q8NGV5 346 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 PHYHIPQ92561 330 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 UQCC2Q9BRT2 126 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 ACOT13Q9NPJ3 140 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 SESN1Q9Y6P5 492 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 PAHP00439 452 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 CD37P11049 281 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 C12orf54Q6X4T0 127 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 ZNF367Q7RTV3 350 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 LINC00596Q86U02 117 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 SUMF2Q8NBJ7 301 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 BEND2Q8NDZ0 799 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 OR11H6Q8NGC7 330 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 MEGF9Q9H1U4 602 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R3Q9NYW6 316 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 ODF3BA8MYP8 253 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 CLPXO76031 633 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
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ACTB-211ENST00000480301 TRAM1Q15629 374 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 TAF9Q16594 264 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 DPAGT1Q9H3H5 408 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-211ENST00000480301 FAM181BA6NEQ2 426 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa17.01■□□□□ 0.31
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ACTB-211ENST00000480301 CGB7P0DN87 165 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 GDNFP39905 211 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ3P48549 501 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 SSX1Q16384 188 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 MPV17LQ2QL34 196 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 C1orf100Q5SVJ3 147 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 GLT8D1Q68CQ7 371 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 ZNF626Q68DY1 528 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 HEPN1Q6WQI6 88 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 TMEM104Q8NE00 496 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 BARHL1Q9BZE3 327 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 TMEM133Q9H2Q1 129 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 BANF2Q9H503 90 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 KIF25Q9UIL4 384 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 ARG1P05089 322 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 CDK2P24941 298 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 PAX6P26367 422 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 GABRA5P31644 462 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 LGALS4P56470 323 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 FABP5Q01469 135 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 FOXL1Q12952 345 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 C17orf58Q2M2W7 97 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 AWAT1Q58HT5 328 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 SPARTQ8N0X7 666 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 OR13A1Q8NGR1 328 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 OR6C3Q9NZP0 311 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 GHRLQ9UBU3 117 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 MEIKINA0A087WXM9 373 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 MGMTP16455 207 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 OMGP23515 440 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 BRICD5Q6PL45 260 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 DYRK2Q92630 601 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 GFI1Q99684 422 aa16.99■□□□□ 0.31
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ACTB-211ENST00000480301 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 LRRC42Q9Y546 428 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 GPR137BO60478 399 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 SVOPQ8N4V2 548 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 ZNF565Q8N9K5 539 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 OR5R1Q8NH85 324 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 Q96M66 194 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 SLITRK2Q9H156 845 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 ARL6IP5O75915 188 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 UBBP0CG47 229 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-211ENST00000480301 GLP1RP43220 463 aa16.97■□□□□ 0.31
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