RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	ARF6	P62330	175 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	C2orf54	Q08AI8	447 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	PSG7	Q13046	419 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	IL18R1	Q13478	541 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	LY6E	Q16553	131 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	IMPG1	Q17R60	797 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC36A3	Q495N2	470 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	C2orf83	Q53S99	150 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	PNKD	Q8N490	385 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	FCRL1	Q96LA6	429 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	TECTB	Q96PL2	329 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	OR2V2	Q96R30	315 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	CCT7	Q99832	543 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	TMCO1	Q9UM00	188 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PRKD3-208	ENST00000475912	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912		A0A1B0GW55	424 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	C5orf49	A4QMS7	147 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	OR10H3	O60404	316 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	C1QC	P02747	245 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	IFNW1	P05000	195 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	GUSB	P08236	651 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	CLU	P10909	449 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	PAX6	P26367	422 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	STOM	P27105	288 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	PMEL	P40967	661 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	CRAT	P43155	626 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	MEOX2	P50222	304 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	SERPINB8	P50452	374 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	PKNOX1	P55347	436 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	HBA1	P69905	142 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DR1	Q01658	176 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	KLRD1	Q13241	179 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	XKR7	Q5GH72	579 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	VRK2	Q86Y07	508 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912		Q8N2B8	174 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	CADM2	Q8N3J6	435 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	SFXN5	Q8TD22	340 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	RORB	Q92753	470 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	ROPN1L	Q96C74	230 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	ERP44	Q9BS26	406 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	TM2D1	Q9BX74	207 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	OR51I1	Q9H343	314 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	C1orf198	Q9H425	327 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DUX4	Q9UBX2	424 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	WDR45	Q9Y484	360 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	DNAH2	Q9P225	4427 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	AIM2	O14862	343 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	NPFF	O15130	113 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	HDAC3	O15379	428 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	RAD51C	O43502	376 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	AHSA1	O95433	338 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRKD3-208	ENST00000475912	FSTL3	O95633	263 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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