RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474593.1

KHDC1-204, Transcript of KH domain containing 1, human

TSL 5

Gene KHDC1, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KHDC1-204	ENST00000474593	OR3A1	P47881	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	KCNJ3	P48549	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	P2RX3	P56373	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	TPBG	Q13641	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ZNF273	Q14593	569 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	INSL4	Q14641	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	IRF3	Q14653	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	SSX2	Q16385	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	TAF9	Q16594	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	LTC4S	Q16873	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593		Q6P435	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	BRICD5	Q6PL45	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	SSX3	Q99909	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CST11	Q9H112	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	BANF2	Q9H503	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	PDCD5	O14737	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	PIN1P1	O15428	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	MPIG6B	O95866	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	RBP4	P02753	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	UBB	P0CG47	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	HKR1	P10072	659 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	MGMT	P16455	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	FST	P19883	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	FUT3	P21217	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	MYL9	P24844	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	PSMB9	P28065	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	HTR1D	P28221	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	HTR2C	P28335	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	GABRA5	P31644	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CEACAM3	P40198	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	GLP1R	P43220	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	IER3	P46695	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ZNF773	Q6PK81	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	DYRK2	Q92630	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CORO2A	Q92828	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KHDC1-204	ENST00000474593	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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