RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ING3Q9NXR8 418 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ODAMA1E959 279 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 LEUTXA8MZ59 168 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 J3QRE1 110 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 KDM4BO94953 1096 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ALDOBP05062 364 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 OR3A4PP47883 348 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 CD69Q07108 199 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ZNF691Q5VV52 312 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 DRAM1Q8N682 238 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 OR56B4Q8NH76 319 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 FGGYQ96C11 551 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 RAX2Q96IS3 184 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 KIRREL1Q96J84 757 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 MNTQ99583 582 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ZNF649Q9BS31 505 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 A0A1W2PPE3 182 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 PSMB11A5LHX3 300 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 KRT8P05787 483 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 HTR1FP30939 366 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 RBP2P50120 134 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ZP1P60852 638 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 DEFB136Q30KP8 78 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 ASCL2Q99929 193 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 AASSQ9UDR5 926 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-206ENST00000474188 A0A087WXM4 84 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 SULT1C4O75897 302 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 OR2T7P0C7T2 308 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 ATP1B3P54709 279 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 MTCP1P56278 107 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 SCN1BQ07699 218 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 HNF4GQ14541 408 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 UTS2BQ765I0 119 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 SATL1Q86VE3 508 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 ZNF596Q8TC21 504 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 PRR25Q96S07 402 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 PSG11Q9UQ72 335 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 J3QR06 171 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 IGHG2P01859 326 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 CSN2P05814 226 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 CRHBPP24387 322 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 NFYBP25208 207 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 BRS3P32247 399 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 MYCNOSP40205 109 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 GABARAPL2P60520 117 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 CDC42P60953 191 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-206ENST00000474188 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms