RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468086.1

RBM39-226, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-226	ENST00000468086	XK	P51811	444 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	GAPT	Q8N292	157 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	TMBIM1	Q969X1	311 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	FMC1	Q96HJ9	113 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	NUP205	Q92621	2012 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	COL18A1	P39060	1754 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086		A0A1B0GXF2	115 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	TCF21	O43680	179 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	MYO1D	O94832	1006 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	GPX1	P07203	203 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	S100A2	P29034	98 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	DAOA	P59103	153 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	POMK	Q9H5K3	350 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	DIABLO	Q9NR28	239 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	CR1	P17927	2039 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	NAPSA	O96009	420 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	EVI2B	P34910	448 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	ARR3	P36575	388 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	EMP2	P54851	167 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	CLDN8	P56748	225 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	APOF	Q13790	326 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	OR4X1	Q8NH49	305 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	CD200R1	Q8TD46	325 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	REEP6	Q96HR9	211 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086		A8MWP6	167 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086		M0QXV9	152 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	LYNX1	P0DP58	116 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	OR8G1	Q15617	311 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	ACTBL2	Q562R1	376 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	BBOF1	Q8ND07	529 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	GTF2H4	Q92759	462 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	LINC01587	Q99440	93 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	VAT1	Q99536	393 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	OR2AG1	Q9H205	316 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	BTRC	Q9Y297	605 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	RGS12	O14924	1447 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	AKR7A2	O43488	359 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	LIPC	P11150	499 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	M6PR	P20645	277 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	TAL2	Q16559	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	OR52B2	Q96RD2	323 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	IFNK	Q9P0W0	207 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	TMEM131	Q92545	1883 aa		0.9	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		0.9	□□□□□ -2.26
RBM39-226	ENST00000468086	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086		A0A0G2JQZ4	141 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	IGSF23	A1L1A6	192 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	ELP2	Q6IA86	826 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	ERMN	Q8TAM6	284 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	DOK4	Q8TEW6	326 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086		Q9BRP9	147 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086		A0A1B0GTQ1	180 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	ARGFX	A6NJG6	315 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	TMEM250	H0YL14	139 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RBM39-226	ENST00000468086	CD8A	P01732	235 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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