RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 OR51F2Q8NH61 342 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PIGCQ92535 297 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SDSLQ96GA7 329 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CEP250Q9BV73 2442 aa6.72□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SLC17A2O00624 439 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CIDEAO60543 219 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 UPK3AO75631 287 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 DKK1O94907 266 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 MPC2O95563 127 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 LY86O95711 162 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 HLA-DQB1P01920 261 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CTLA4P16410 223 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 M0R135 149 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZFPL1O95159 310 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 COX5AP20674 150 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 PLA1AQ53H76 456 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SLC35G3Q8N808 338 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF799Q96GE5 643 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PARP11Q9NR21 331 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.71□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 K7ENP7 123 aa6.71□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 SYT9Q86SS6 491 aa6.71□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DYRK2Q92630 601 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KCNJ15Q99712 375 aa6.71□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SVILO95425 2214 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SLC25A4P12235 298 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 PRR27Q6MZM9 219 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.71□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.71□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FAM74A7A6NL05 159 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FBP1P09467 338 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FPR2P25090 351 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SULT1A1P50225 295 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FOXL2P58012 376 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TAS2R60P59551 318 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 UBE2V2Q15819 145 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 WDR73Q6P4I2 378 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 DTD1Q8TEA8 209 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 HSD17B8Q92506 261 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 EMC6Q9BV81 110 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KLK11Q9UBX7 282 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CLDN1O95832 211 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ASCL1P50553 236 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DHRS2Q13268 280 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KCNMB1Q16558 191 aa6.7□□□□□ -1.34
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