RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	SNAPC5	O75971	98 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ERG	P11308	486 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MYL9	P24844	172 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SDC2	P34741	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CA5A	P35218	305 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HTR2B	P41595	481 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR4	P46093	362 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	FABP6	P51161	128 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	AP1S2	P56377	157 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB14	P61106	215 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR176	Q14439	515 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TESC	Q96BS2	214 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MGLL	Q99685	303 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CIT	O14578	2027 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378		F5H5T6	163 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GABRP	O00591	440 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MYL12B	O14950	172 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ORC5	O43913	435 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2B3	O76000	313 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PIRT	P0C851	137 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ATF6	P18850	670 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ARR3	P36575	388 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SPAM1	P38567	509 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SMIM11A	P58511	58 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HERVK_113	P61574	105 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1CB	P62140	327 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP3R1	P63098	170 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	DOHH	Q9BU89	302 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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