RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462155.2

IFRD1-210, Transcript of interferon related developmental regulator 1, human

TSL 5

Gene IFRD1, Length 437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF91	Q05481	1191 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	AES	Q08117	197 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	LTC4S	Q16873	150 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	WDR93	Q6P2C0	686 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	OR2T33	Q8NG76	320 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	STON2	Q8WXE9	905 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KIRREL1	Q96J84	757 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	C7orf34	Q96L11	122 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	S1PR3	Q99500	378 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KRT84	Q9NSB2	600 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	FAM206A	Q9NX38	181 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	COPS3	Q9UNS2	423 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155		V9GYQ6	96 aa		5	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155		H0Y980	276 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SH2D1B	O14796	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	CNIH1	O95406	144 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	CYB5A	P00167	134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	PRKACA	P17612	351 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	RRM2	P31350	389 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	GLP1R	P43220	463 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	RAB9A	P51151	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	CDC42	P60953	191 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KLF10	Q13118	480 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	EBI3	Q14213	229 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ODF1	Q14990	250 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM42	Q69YG0	159 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155		Q8IYB0	196 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155		Q8N6K4	173 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155		A0A1W2PPE3	182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155		G3V318	75 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	NME4	O00746	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ENTPD6	O75354	484 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	GMNN	O75496	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SOX14	O95416	240 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	OR2H2	O95918	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	MOS	P00540	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF44	P15621	663 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	BCL3	P20749	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	NPBWR2	P48146	333 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	FUT6	P51993	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SCN1B	Q07699	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61	8e-8	■■■□□ 18.2
IFRD1-210	ENST00000462155	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF146	Q15072	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	RCN3	Q96D15	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFRD1-210	ENST00000462155	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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