RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MGMT	P16455	207 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	MIDN	Q504T8	468 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	COQ2	Q96H96	371 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241		Q96M66	194 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241		V9GY05	133 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CA11	O75493	328 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	AES	Q08117	197 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM86B	Q8N661	226 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SSR3	Q9UNL2	185 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CUBN	O60494	3623 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PP11	408 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM77	I1YAP6	450 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	NPFF	O15130	113 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CLPX	O76031	633 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CCL3L1	P16619	93 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FUT3	P21217	361 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GLIPR1	P48060	266 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	QRFP	P83859	136 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	RAB11B	Q15907	218 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TAF9	Q16594	264 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GFI1	Q99684	422 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPA-222	ENST00000445241	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	VENTX	O95231	258 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	FBP1	P09467	338 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ARSB	P15848	533 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RAB3B	P20337	219 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	NEDD8	Q15843	81 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241		Q6YL49	198 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	BANF2	Q9H503	90 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM127	O75204	238 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	PDCD6	O75340	191 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	CGB3	P0DN86	165 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	CGB7	P0DN87	165 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	GZMH	P20718	246 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	CD34	P28906	385 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	KLRD1	Q13241	179 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	GAPT	Q8N292	157 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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