RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 OR13A1Q8NGR1 328 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 OR52N1Q8NH53 320 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 OR2T6Q8NHC8 308 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 ZNF702PQ9H963 129 aa11.14□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 Q499Y3 187 aa11.12□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 ASCL4Q6XD76 172 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 STX19Q8N4C7 294 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 MRGPRDQ8TDS7 321 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 KIRREL1Q96J84 757 aa11.12□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 SERTAD4Q9NUC0 356 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa11.12□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.12□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 SSTR5P35346 364 aa11.11□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 MED21Q13503 144 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 HERPUD1Q15011 391 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZTK2 550 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 RFESDQ8TAC1 157 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 UBALD1Q8TB05 177 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.11□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 METTL9Q9H1A3 318 aa11.11□□□□□ -0.63
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PRAME-209ENST00000439106 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 CGB3P0DN86 165 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 CGB7P0DN87 165 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 CELP19835 753 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 GNG10P50151 68 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 AQP4P55087 323 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 WNT4P56705 351 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 INSL4Q14641 139 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DRB5Q30154 266 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-209ENST00000439106 YIF1BQ5BJH7 314 aa11.1□□□□□ -0.63
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