RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428222.1

AC004835.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC004835.1, Length 2,907 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004835.1-201ENST00000428222 ARL6IP1Q15041 203 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 EXT1Q16394 746 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 C12orf49Q9H741 205 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 KPTNQ9Y664 436 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 A0A087WZY1 265 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 WRBO00258 174 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 B2MP61769 119 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 OR2C3Q8N628 320 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 HLA-CQ95604 372 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 C18orf12Q96KH6 178 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF732B4DXR9 585 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 H0YL77 283 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 TMEM50AO95807 157 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 RPS10P46783 165 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 GLRX2Q9NS18 164 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.58□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 LAMA5O15230 3695 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 NUDT19A8MXV4 375 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 DYNLT3P51808 116 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 PRDX4Q13162 271 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 ACER2Q5QJU3 275 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 MOB3AQ96BX8 217 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 LINC00587B1AMM8 73 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 FGF5P12034 268 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 FUT6P51993 359 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 COL19A1Q14993 1142 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.57□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 OR6C6A6NF89 314 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 H7C1Q1 480 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 CST2P09228 141 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 CHST1O43916 411 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 TK1P04183 234 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 IAPPP10997 89 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 BOD1Q96IK1 185 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.56□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 YIF1AO95070 293 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 DTYMKP23919 212 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 IL11RAQ14626 422 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 HERPUD1Q15011 391 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 RTL6Q6ICC9 239 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 IFT22Q9H7X7 185 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 LRFN1Q9P244 771 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 HSF4Q9ULV5 492 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 A0A0G2JRQ6 117 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 GJE1A6NN92 205 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 PROB1E7EW31 1015 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 RAB5AP20339 215 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 GALNT14Q96FL9 552 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 SGCZQ96LD1 299 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 WDR54Q9H977 334 aa14.55□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 OR2C1O95371 312 aa14.54□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 SEC11BP0C7V7 166 aa14.54□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 ECI1P42126 302 aa14.54□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.54□□□□□ -0.08
AC004835.1-201ENST00000428222 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms