RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 RASL10BQ96S79 203 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 EHFQ9NZC4 300 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 C22orf46C9J442 243 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 BNIP3LO60238 219 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LDB3O75112 727 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 VAMP5O95183 116 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 CTSEP14091 401 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 AMY2BP19961 511 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 UCP1P25874 307 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 SHBQ15464 509 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ADIRFQ15847 76 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LHX8Q68G74 356 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 FCRL6Q6DN72 434 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LCN10Q6JVE6 187 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 PRR13Q9NZ81 148 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 A0A1W2PQM1 296 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 WIPF3A6NGB9 483 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ARL5CA6NH57 179 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 OR2AG2A6NM03 316 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TRAPPC6AO75865 159 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 CTSBP07858 339 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 CD99P14209 185 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ANOS1P23352 680 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 DUSP1P28562 367 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TSPOP30536 169 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 PTGER4P35408 488 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 SSR2P43308 183 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 DNASE1L1P49184 302 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 BIDP55957 195 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 RAB38P57729 211 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LCN6P62502 163 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 PAX2Q02962 417 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TAF10Q12962 218 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LYPD6Q86Y78 171 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LRTM2Q8N967 370 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 STARD4Q96DR4 205 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LMLNQ96KR4 655 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 MANBALQ9NQG1 85 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 COL4A3Q01955 1670 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM202A6NGA9 273 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 MSTNO14793 375 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 KBTBD11O94819 623 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 CDS2O95674 445 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 CD55P08174 381 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 BAXQ07812 192 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 MSMO1Q15800 293 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 FADS6Q8N9I5 356 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00501-201ENST00000425388 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms