RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384199.1

RNU6-1024P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1024, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1024P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LINC00208Q96KT6 92 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM243Q9BU79 118 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ACAT2Q9BWD1 397 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MND1Q9BWT6 205 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HSD3B7Q9H2F3 369 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CCDC68Q9H2F9 335 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TAOK3Q9H2K8 898 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM138Q9NPI0 162 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ORMDL1Q9P0S3 153 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SNX24Q9Y343 169 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FAM169AQ9Y6X4 670 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 USP34Q70CQ2 3546 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GSTA1P08263 222 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GSTA2P09210 222 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NEFHP12036 1026 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LBPP18428 481 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CD24P25063 80 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GJB2P29033 226 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CA5AP35218 305 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 XCL1P47992 114 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RRAGAQ7L523 313 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UBAC2Q8NBM4 344 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DSCR8Q96T75 97 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MGLLQ99685 303 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ALG12Q9BV10 488 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CCDC106Q9BWC9 280 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ITPAQ9BY32 194 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GALPQ9UBC7 116 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HELZP42694 1942 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ANK1P16157 1881 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MAGI2Q86UL8 1455 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 A0A0G2JMP0 313 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 A0A0X1KG70 313 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 A0A1W2PQD3 144 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR5K4A6NMS3 321 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 H3BRM9 83 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 L7N2F9 121 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CDC7O00311 574 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SH2D1BO14796 132 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CTNSO60931 367 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UPK3AO75631 287 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 IFNGP01579 166 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM11P17152 192 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ARR3P36575 388 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CEACAM3P40198 252 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CASP2P42575 452 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OSTNP61366 133 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HSPA14Q0VDF9 509 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 APOFQ13790 326 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TRAM2Q15035 370 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MAPRE2Q15555 327 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LINC00303Q3SY05 128 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TPRG1LQ5T0D9 272 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 Q6ZSR6 202 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ITPRIPQ8IWB1 547 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DRAM1Q8N682 238 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR52K1Q8NGK4 314 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC35G2Q8TBE7 412 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FAM57AQ8TBR7 257 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR5B2Q96R09 309 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PLIN2Q99541 437 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KCNS3Q9BQ31 491 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR51B5Q9H339 312 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM27Q9HBJ8 222 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 STAP1Q9ULZ2 295 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KIF24Q5T7B8 1368 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ELP1O95163 1332 aa-4.41□□□□□ -3.11
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TRIM64A6NGJ6 449 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TVP23AA6NH52 213 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1024P-201ENST00000384199 I3L2K1 104 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC30A4O14863 429 aa-4.41□□□□□ -3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms