RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 K7ENP7 123 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 OR2H2O95918 312 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TNFSF4P23510 183 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 NRN1LQ496H8 165 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 PXT1Q8NFP0 134 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 IFNA7P01567 189 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 RAG2P55895 527 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 WDR31Q8NA23 367 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 A0A0G2JNJ9 132 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ZNF529Q6P280 563 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 OR8G5Q8NG78 346 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ARL11Q969Q4 196 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 Q9UFV3 132 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 OPN4Q9UHM6 478 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 FBXO24O75426 580 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 HAND1O96004 215 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 CEACAM6P40199 344 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 KIR2DS4P43632 304 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 KIR2DS1Q14954 304 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ELP2Q6IA86 826 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 CDH26Q8IXH8 852 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 PLK3Q9H4B4 646 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 GP6Q9HCN6 339 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 ZNF735P0CB33 412 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TBPP20226 339 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 VAMP2P63027 116 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 IFITM2Q01629 132 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TMEM200AQ86VY9 491 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 HINT2Q9BX68 163 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HPS1-204ENST00000361490 A0A1W2PPE3 182 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 I3L521 148 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MELTFP08582 738 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 FPR2P25090 351 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PTAFRP25105 342 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PTPN13Q12923 2485 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 H3BP45 60 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PPYP01298 95 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 EDARQ9UNE0 448 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CENPEQ02224 2701 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MSTNO14793 375 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CST4P01036 141 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 S100A11P31949 105 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CD80P33681 288 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SSX9Q7RTT3 188 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 GAPTQ8N292 157 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 NGBQ9NPG2 151 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 LRP5LA4QPB2 252 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CD74P04233 296 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TMUB2Q71RG4 321 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms