RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 IGF2P01344 180 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 COX6A1P12074 109 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TGIF1Q15583 401 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NEURL2Q9BR09 285 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CLN8Q9UBY8 286 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR90Q96KV7 1748 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf51C9J302 202 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 INHBBP09529 407 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CSRP3P50461 194 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IL24Q13007 206 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCC3Q6UW78 93 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NECAP1Q8NC96 275 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT2BQ93097 391 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DIRC2Q96SL1 478 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NPTNQ9Y639 398 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV3-19P01714 112 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 SPINK2P20155 84 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 V9GYH0 126 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 G3V3Q6 166 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNGR2O43760 224 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 GFRA3O60609 400 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PAX6P26367 422 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 RHOBP62745 196 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM3AP98173 230 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 MIDNQ504T8 468 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 ASCL1P50553 236 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 H3F3AP84243 136 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PCOLCEQ15113 449 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 HMSDA8MTL9 139 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 F2RL2O00254 374 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PGA4P0DJD7 388 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 TNXAQ16473 311 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 GUK1Q16774 197 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK17Q96T54 332 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAP1O75689 374 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 CD200P41217 278 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 ROM1Q03395 351 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 FHL5Q5TD97 284 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 IL11P20809 199 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 KIR3DL2P43630 455 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGYQ3MUY2 71 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF122Q9H9V4 155 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 TREM2Q9NZC2 230 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 MGAT2Q10469 447 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 GAPTQ8N292 157 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL17Q9UF56 701 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PNV4 684 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 K7ESF4 209 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 FSTP19883 344 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 CACNA1EQ15878 2313 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPQ1 181 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIAL4DF5H284 164 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 H0Y8G0 127 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF205O95201 554 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 UCP2P55851 309 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 CSRP2Q16527 193 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 LNP1A1A4G5 178 aa14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms