RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 IMMP2LQ96T52 175 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 KCNE5Q9UJ90 142 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 POU2F2P09086 479 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 FAHP16930 419 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 HOGA1Q86XE5 327 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 MGST2Q99735 147 aa4.89□□□□□ -1.63
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