RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM234AQ9H0X4 552 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGST3O14880 152 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ORC5O43913 435 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TK1P04183 234 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM155Q4W5P6 130 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC2AQ6UVW9 174 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 SETD6Q8TBK2 473 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 OCSTAMPQ9BR26 566 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 PALMDQ9NP74 551 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFB3O43676 98 aa22.87■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DTYMKP23919 212 aa22.87■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KAAG1Q9UBP8 84 aa22.87■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LYPD2Q6UXB3 125 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF497Q6ZNH5 498 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOMM5Q8N4H5 51 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM168AQ92567 244 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM63Q969Q1 353 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIOXQ9UGB7 285 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35E4Q6ICL7 350 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLRC3Q7RTR2 1065 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 GVQW1Q8N7I0 195 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIMREGQ9BSJ6 248 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DSCR9P59020 149 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUX4Q9UBX2 424 aa22.84■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EDDM3BP56851 147 aa22.83■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8B2Q96RD0 313 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEIKINA0A087WXM9 373 aa22.82■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFA3P59666 94 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB113Q30KQ7 82 aa22.82■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-201ENST00000318988 COX4I2Q96KJ9 171 aa22.82■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF25Q9UIL4 384 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R19P59542 299 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOB1BQ7L9L4 216 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYSMD2Q8IV50 215 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEST4Q8NFU0 473 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 COQ2Q96H96 371 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGAT4AQ9UM21 535 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa22.81■■□□□ 1.24
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