RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFB7P17568 137 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 BSPH1Q075Z2 132 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR8G5Q8NG78 346 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PRR7Q8TB68 274 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MIOXQ9UGB7 285 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM82A0PJX8 343 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 DPRXA6NFQ7 191 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CD74P04233 296 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CD40P25942 277 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 UQCRFS1P47985 274 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 BTG1P62324 171 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF573Q86YE8 665 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PRR18Q8N4B5 295 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PRORYQ9H606 182 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MLXQ9UH92 298 aa9.31□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 A6NJY4 79 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SLC22A5O76082 557 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 NXPH2O95156 264 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MBP02144 154 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 LURAP1Q96LR2 239 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 GPHA2Q96T91 129 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 USF3Q68DE3 2245 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 C7orf66A4D0T2 115 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PDCD6O75340 191 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SCGNO76038 276 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 FCGR3AP08637 254 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 FUT3P21217 361 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 FXYD4P59646 89 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 FGF12P61328 243 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TECTBQ96PL2 329 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SSX3Q99909 188 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OPA3Q9H6K4 179 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SPG11Q96JI7 2443 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR5B21A6NL26 309 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SERPINE3A8MV23 424 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 DISC1C4P0D8 188 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CCSO14618 274 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 FABP7O15540 132 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 GLRA1P23415 457 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM17Q86X19 198 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 HOGA1Q86XE5 327 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 METRNQ9UJH8 293 aa9.3□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 LRRK2Q5S007 2527 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MED13LQ71F56 2210 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR5H14A6NHG9 310 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 KNG1P01042 644 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TOMM40LQ969M1 308 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00052Q96N35 136 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PFDN5Q99471 154 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 J3QT63 122 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PLAUP00749 431 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR4E1P0C645 316 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 DEFA6Q01524 100 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 Q8NFD4 153 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 IL36GQ9NZH8 169 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms