RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	ABCA1	O95477	2261 aa		18.6	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	MEIOC	A2RUB1	952 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	SIRPB1	O00241	398 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	LYRM1	O43325	122 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	PTHLH	P12272	177 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	SELL	P14151	372 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	CHAT	P28329	748 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	BRICD5	Q6PL45	260 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	LINC00596	Q86U02	117 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	GAFA1	Q96PS6	74 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	CCL13	Q99616	98 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM82	A0PJX8	343 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	NDUFS8	O00217	210 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	PSPN	O60542	156 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FCN3	O75636	299 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	LPL	P06858	475 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC25A16	P16260	332 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	GABRA2	P47869	451 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	AP3S2	P59780	193 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	COL10A1	Q03692	680 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB1C	Q92928	201 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	SDSL	Q96GA7	329 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	TIMD4	Q96H15	378 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FAM53B-201	ENST00000280780	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	MFNG	O00587	321 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SH2D1B	O14796	132 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	DEGS1	O15121	323 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF737	O75373	536 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	GSTT2B	P0CG30	244 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF44	P15621	663 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SPN	P16150	400 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	LMO1	P25800	156 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB3C	Q96E17	227 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	KLK11	Q9UBX7	282 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	HSPB6	O14558	160 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	PDCD6	O75340	191 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	IL2RG	P31785	369 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ARL6IP1	Q15041	203 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CDNF	Q49AH0	187 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780		Q6ZTK2	550 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	NF1	P21359	2839 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CA11	O75493	328 aa		18.56	■□□□□ 0.56

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