RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.69□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ARID1AO14497 2285 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 HSPB6O14558 160 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 WNT9BO14905 357 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SPRY3O43610 288 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SSNA1O43805 119 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 DANCRP0C864 163 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TAS2R46P59540 309 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SELENOVP59797 346 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF146Q15072 292 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 OR2V2Q96R30 315 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.68□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 OR2AT4A6NND4 320 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 VSTM5A8MXK1 200 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 NAPSAO96009 420 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 IGHV1-46P01743 117 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 HPXP02790 462 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SOD3P08294 240 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 OR4A8P0C604 315 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF81P51508 661 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TESK1Q15569 626 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM17Q86X19 198 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.67□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 DEGS1O15121 323 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 OR2H2O95918 312 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 RLN1P04808 185 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CD83Q01151 205 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 RDH5Q92781 318 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 EHFQ9NZC4 300 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 VSIG4Q9Y279 399 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 USF3Q68DE3 2245 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM82A0PJX8 343 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 GLAP06280 429 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ANXA3P12429 323 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF44P15621 663 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 EGR1P18146 543 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 OR3A3P47888 321 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CDK10Q15131 360 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 MUC15Q8N387 334 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 LRRC29Q8WV35 223 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 PERPQ96FX8 193 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 PPA2Q9H2U2 334 aa14.66□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 SIRPB1O00241 398 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 GLRA1P23415 457 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CFHR2P36980 270 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 NOXA1Q86UR1 476 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 DTX2Q86UW9 622 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 MOGAT3Q86VF5 341 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 NEK7Q8TDX7 302 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 GSX2Q9BZM3 304 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF1-201ENST00000258962 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SH2D1BO14796 132 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 HAND1O96004 215 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 C1QBP02746 253 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GATA4P43694 442 aa14.64□□□□□ -0.07
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