RNA–Protein interactions for RNA: YKL062W

MSN4, Transcript of Stress-responsive transcriptional activator, yeast

Gene MSN4, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSN4	YKL062W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	NGG1	P32494	702 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	YKL133C	P36066	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	RPP1	P38786	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	ERR3	P42222	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	SGM1	P47166	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	BTN2	P53286	410 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	CDC45	Q08032	650 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	BEM3	P32873	1128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	ACA1	P39970	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	MAM1	P40065	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	RAD18	P10862	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	SPO16	P17122	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	BCD1	P38772	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	YHR218W	P38899	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	ERG5	P54781	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	MSS18	P08593	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	DPH2	P32461	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	HOG1	P32485	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	PFA3	P42836	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	NIT2	P47016	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	MET13	P53128	600 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	NSE5	Q03718	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	NHX1	Q04121	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	PGC1	Q08959	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	YFL052W	P43551	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	IML2	P47031	731 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	BUL1	P48524	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	OPY2	Q06810	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	CEX1	Q12453	761 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSN4	YKL062W	SPT7	P35177	1332 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YLR415C	O13578	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PCL2	P25693	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	DAL3	P32459	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YEL1	P34225	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	HSL7	P38274	827 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	DJP1	P40564	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	BNA2	P47125	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MSE1	P48525	536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MRPS35	P53292	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	GTR1	Q00582	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	AEP2	P22136	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SAN1	P22470	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PXA2	P34230	853 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	FKH2	P41813	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YJR096W	P47137	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SUN4	P53616	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ASM4	Q05166	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	CIA1	Q05583	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PUS9	Q12069	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	GPR1	Q12361	961 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ERG4	P25340	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	KIN4	Q01919	800 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	COG8	Q04632	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SFL1	P20134	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MIH1	P23748	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YKL100C	P34248	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RRF1	P38771	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	QRI7	P43122	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YAP1802	P53309	568 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	NRG1	Q03125	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	DLT1	Q04216	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	UBS1	P38290	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SUL1	P38359	859 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	POP2	P39008	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	AIM14	P53109	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ATG33	Q06485	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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