RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641928.1

MFSD8-255, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 4,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-255	ENST00000641928	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	PTPRC	P08575	1304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	A2M	P01023	1474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L15	C9J2P7	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L10	C9JJH3	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L12	C9JPN9	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L11	C9JVI0	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L21	D6R901	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L18	D6R9N7	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L22	D6RA61	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L19	D6RCP7	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L20	D6RJB6	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L24	Q0WX57	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	AOX1	Q06278	1338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SLF2	Q8IX21	1173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	NEFH	P12036	1026 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	LIG1	P18858	919 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ERCC3	P19447	782 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67	2e-7	■■■■□ 22.1
MFSD8-255	ENST00000641928	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	MED14	O60244	1454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	GNAI1	P63096	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	MAGEA9	P43362	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	TOMM20	Q15388	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	KRT85	P78386	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-255	ENST00000641928	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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