RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638158.1

CREBBP-220, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene CREBBP, Length 97 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-220ENST00000638158 RBSNQ9H1K0 784 aa7.4□□□□□ -1.22
CREBBP-220ENST00000638158 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.4□□□□□ -1.22
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CREBBP-220ENST00000638158 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.4□□□□□ -1.22
CREBBP-220ENST00000638158 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CREBBP-220ENST00000638158 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.4□□□□□ -1.22
CREBBP-220ENST00000638158 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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CREBBP-220ENST00000638158 ST8SIA5O15466 376 aa7.35□□□□□ -1.23
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CREBBP-220ENST00000638158 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.35□□□□□ -1.23
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CREBBP-220ENST00000638158 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.34□□□□□ -1.23
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CREBBP-220ENST00000638158 RAB33AQ14088 237 aa7.34□□□□□ -1.23
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CREBBP-220ENST00000638158 TNNI3KQ59H18 835 aa7.34□□□□□ -1.23
CREBBP-220ENST00000638158 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.34□□□□□ -1.23
CREBBP-220ENST00000638158 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.34□□□□□ -1.23
CREBBP-220ENST00000638158 SYT9Q86SS6 491 aa7.34□□□□□ -1.23
CREBBP-220ENST00000638158 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CREBBP-220ENST00000638158 FBXO27Q8NI29 283 aa7.34□□□□□ -1.23
CREBBP-220ENST00000638158 PPT2Q9UMR5 302 aa7.34□□□□□ -1.23
CREBBP-220ENST00000638158 FAM177BA6PVY3 158 aa7.33□□□□□ -1.24
CREBBP-220ENST00000638158 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CREBBP-220ENST00000638158 CPB1P15086 417 aa7.33□□□□□ -1.24
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