RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637050.1

CLN3-254, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,684 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-254ENST00000637050 MAP4K1Q92918 833 aa22.17■■□□□ 1.14
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CLN3-254ENST00000637050 ANAPC15P60006 121 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-254ENST00000637050 UBE3CQ15386 1083 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-254ENST00000637050 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-254ENST00000637050 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.16■■□□□ 1.14
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CLN3-254ENST00000637050 MAST3O60307 1309 aa22.16■■□□□ 1.14
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CLN3-254ENST00000637050 MAP3K12Q12852 859 aa22.15■■□□□ 1.14
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CLN3-254ENST00000637050 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLN3-254ENST00000637050 SLX4Q8IY92 1834 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN3-254ENST00000637050 PDE6AP16499 860 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN3-254ENST00000637050 POLD1P28340 1107 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN3-254ENST00000637050 WASHC4Q2M389 1173 aa22.14■■□□□ 1.14
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CLN3-254ENST00000637050 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.14■■□□□ 1.14
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CLN3-254ENST00000637050 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 C6orf229H3BNL8 230 aa22.14■■□□□ 1.13
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CLN3-254ENST00000637050 PALD1Q9ULE6 856 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 NECTIN1Q15223 517 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN3-254ENST00000637050 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 RABEP1Q15276 862 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 KCNB2Q92953 911 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 IL1R1P14778 569 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 CD209Q9NNX6 404 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 KCNA3P22001 575 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 ABCF2Q9UG63 623 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 SNED1Q8TER0 1413 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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CLN3-254ENST00000637050 TTLL6Q8N841 843 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 SNX21Q969T3 373 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.09■■□□□ 1.13
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CLN3-254ENST00000637050 A0A0G2JLW4 131 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN3-254ENST00000637050 TGFB2P61812 414 aa22.08■■□□□ 1.13
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CLN3-254ENST00000637050 EYA3Q99504 573 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 COA1Q9GZY4 146 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 SLC27A2O14975 620 aa22.06■■□□□ 1.12
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CLN3-254ENST00000637050 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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CLN3-254ENST00000637050 PTGER2P43116 358 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 ZNF384Q8TF68 577 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 C21orf2O43822 256 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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CLN3-254ENST00000637050 PRDX5P30044 214 aa22.04■■□□□ 1.12
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CLN3-254ENST00000637050 AIDAQ96BJ3 306 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 JAG2Q9Y219 1238 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 MECOMQ03112 1051 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CLN3-254ENST00000637050 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.03■■□□□ 1.12
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