RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629039.2

FHL1-229, Transcript of four and a half LIM domains 1, human

TSL 2 BASIC

Gene FHL1, Length 1,501 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FHL1-229	ENST00000629039	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	ITGA6	P23229	1130 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	CHRND	Q07001	517 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	RASA3	Q14644	834 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FHL1-229	ENST00000629039		H7C1W4	665 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	RALBP1	Q15311	655 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	TAF5L	O75529	589 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	MYO1B	O43795	1136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	KCNJ4	P48050	445 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	CSF1R	P07333	972 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	CASP7	P55210	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	CCL15	Q16663	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	DLL1	O00548	723 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	IL1R1	P14778	569 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	GNAI1	P63096	354 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	G2E3	Q7L622	706 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	VGLL4	Q14135	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	MTFR1	Q15390	333 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	GTF2A2	P52657	109 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	DPF3	Q92784	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	APAF1	O14727	1248 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	CTGF	P29279	349 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	GCKR	Q14397	625 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FHL1-229	ENST00000629039	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FHL1-229	ENST00000629039	TLR2	O60603	784 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FHL1-229	ENST00000629039	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FHL1-229	ENST00000629039	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.7	□□□□□ -0.22
FHL1-229	ENST00000629039	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FHL1-229	ENST00000629039	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FHL1-229	ENST00000629039	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.69	□□□□□ -0.22
FHL1-229	ENST00000629039	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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