RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-215	ENST00000624145	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TXNDC9	O14530	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	BACH1	O14867	736 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RFC4	P35249	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RTN1	Q16799	776 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ESR2	Q92731	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CUX1	P39880	1505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	HAND2	P61296	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZBTB43	O43298	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SPOP	O43791	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TUBB	P07437	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	BIRC3	Q13489	604 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SKIL	P12757	684 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	GPT	P24298	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SSFA2	P28290	1259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	KRT9	P35527	623 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	UBXN1	Q04323	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RTL9	Q8NET4	1388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SYT1	P21579	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CALML3	P27482	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PICALM	Q13492	652 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	IRX4	P78413	519 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	MAN1A1	P33908	653 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	TNNI2	P48788	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	DHX58	Q96C10	678 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145		A0A1B0GUL7	405 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ANKRD28-215	ENST00000624145	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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