RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	SEMA3E	O15041	775 aa		33.36	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	TTLL6	Q8N841	843 aa		33.36	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	WASHC4	Q2M389	1173 aa		33.35	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	KCNB2	Q92953	911 aa		33.35	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		33.35	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	GYG1	P46976	350 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	MAP3K12	Q12852	859 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	NECTIN1	Q15223	517 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	MAST3	O60307	1309 aa		33.34	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	ADD2	P35612	726 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	UBE3C	Q15386	1083 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	ZBTB22	O15209	634 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	MCM2	P49736	904 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BRF1-221	ENST00000619151	DOCK2	Q92608	1830 aa		33.32	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	CHGB	P05060	677 aa		33.32	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		33.32	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		33.32	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	NEK4	P51957	841 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	SP8	Q8IXZ3	490 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	SLX4	Q8IY92	1834 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	ATP2B4	P23634	1241 aa		33.3	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	OSBP2	Q969R2	916 aa		33.3	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151		M0R2C6	588 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	SLC27A2	O14975	620 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	PDE6A	P16499	860 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	RASEF	Q8IZ41	740 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		33.28	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		33.27	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	PSMA5	P28066	241 aa		33.27	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		33.27	■■■□□ 2.92
BRF1-221	ENST00000619151	KRT32	Q14532	448 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	GGA1	Q9UJY5	639 aa		33.26	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	GPSM2	P81274	684 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	KLRK1	P26718	216 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	CACNA1S	Q13698	1873 aa		33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	GPAA1	O43292	621 aa		33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	UFL1	O94874	794 aa		33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	SLC51A	Q86UW1	340 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		33.22	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	C21orf2	O43822	256 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	IGSF3	O75054	1194 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	SOGA3	Q5TF21	947 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		33.2	■■■□□ 2.91
BRF1-221	ENST00000619151	VPS53	Q5VIR6	699 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	AIDA	Q96BJ3	306 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	ABCF2	Q9UG63	623 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	BCS1L	Q9Y276	419 aa		33.19	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	SNED1	Q8TER0	1413 aa		33.18	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	OLFM4	Q6UX06	510 aa		33.18	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	RAI14	Q9P0K7	980 aa		33.18	■■■□□ 2.9

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