RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616761.1

TTLL9-209, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 9, human

TSL 5

Gene TTLL9, Length 1,808 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL9-209	ENST00000616761	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	STX6	O43752	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CASP7	P55210	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	MYH3	P11055	1940 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	ADCY5	O95622	1261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	NTSR2	O95665	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	F13A1	P00488	732 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	KDM4A	O75164	1064 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	RASSF7	Q02833	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SIL1	Q9H173	461 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	IL25	Q9H293	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	LMNB1	P20700	586 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SYT1	P21579	422 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	KCNB2	Q92953	911 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL9-209	ENST00000616761	AK2	P54819	239 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	SERPINB2	P05120	415 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	FOXO4	P98177	505 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	HIP1	O00291	1037 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TFCP2	Q12800	502 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL9-209	ENST00000616761	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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