RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 OSBP2Q969R2 916 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 AIDAQ96BJ3 306 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 MAST3O60307 1309 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 M0R2C6 588 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ZNF202O95125 648 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 XAGE2Q96GT9 111 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 MTMR7Q9Y216 660 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 GSDMDP57764 484 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 FGAP02671 866 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 C3P01024 1663 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ERBB3P21860 1342 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ZNF609O15014 1411 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 B4E1Z4 1266 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 AGLP35573 1532 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 MED23Q9ULK4 1368 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 GPAA1O43292 621 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 TMEM67Q5HYA8 995 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ERICH2A1L162 156 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 CYP27B1O15528 508 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 TDO2P48775 406 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 DIP2AQ14689 1571 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ANO1Q5XXA6 986 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 CLIC6Q96NY7 704 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 KCNB2Q92953 911 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 TEX35Q5T0J7 233 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 NAPBQ9H115 298 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS1-215ENST00000613394 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.96■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 CTDNEP1O95476 244 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 PXDNQ92626 1479 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 PNOCQ13519 176 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 SYNE4Q8N205 404 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ABCF2Q9UG63 623 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ATP1A3P13637 1013 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 PFKFB1P16118 471 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 FANCCQ00597 558 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 IQCB1Q15051 598 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ADALQ6DHV7 355 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 OGFRQ9NZT2 677 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ZBTB43O43298 467 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 CDKL5O76039 1030 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 GNG11P61952 73 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 CCDC102BQ68D86 513 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 KRT222Q8N1A0 295 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 IL17RAQ96F46 866 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 INCENPQ9NQS7 918 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ZNF827Q17R98 1081 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 HSPA2P54652 639 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 DMTNQ08495 405 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 SCARF1Q14162 830 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 KRT40Q6A162 431 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 VPS37DQ86XT2 251 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 CBFA2T2O43439 604 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
HPS1-215ENST00000613394 AFMP43652 599 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms